乙肝病毒由于其本身的特点较容易发生变异，在慢性感染过程中，乙肝病毒变异可自发或在治疗后发生。据报道乙肝病毒的每一个基因和每一种病毒蛋白都可发生变异突变，使其感染后临床表现多样化、临床经过复杂化，以及治疗困难化。目前已经发现的比较重要的乙肝病毒变异有以下几种：一是可以造成乙肝疫苗接种失败的变异，二是可以导致小三阳慢性乙肝病毒的变异，三是可以对抗病毒治疗产生乙肝病毒耐药的变异，后者主要发生在药物与病毒结合的位置，当乙肝病毒基因发生变异时，这些结合位点的空间结构发生改变，药物与病毒的结合能力下降，因而导致乙肝病毒变异耐药。
出现乙肝病毒变异后伴有病情加重时，建议在加强综合治疗措施的同时，采取积极有效的方法，如改用或联合阿德福韦治疗。当检测出YMDD变异后继续拉米夫定治疗，部分病人病情仍可继续改善，可能与拉米夫定对残余其它病毒抑制有关。阿德福韦是继拉米夫定后的另一种口服抗病毒药物，相关病毒变异发生率较低，3年累计耐药发生率仅为5%。抗病毒治疗一定要在医生的指导下进行，定期随访，复查肝功能、肾功能、病毒指标（包括“二对半”、病毒定量、病毒变异情况）、血常规等。
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